为探究闽江不同河段河蚬的形态学和线粒体基因遗传多样性,本研究在闽江的6个不同河段[延平(YP)、闽侯(MH)、龙祥岛(LXD)、马尾(MW)、长乐(CL)和连江(LJ)]共随机采集180个河蚬样品,测量和分析其形态学数据,并以线粒体COⅠ、Cyt b和16S rRNA基因部分序列作为分子标记,进行PCR扩增与测序分析。结果显示:闽江6个不同河段河蚬壳长、壳高和壳宽的变异系数较小,而软体重、壳重和总重的变异系数较大,其中软体重的变异系数最大的群体为LJ(53.30%)。获得线粒体COⅠ、Cyt b和16S rRNA基因序列片段长度分别为444、466、364 bp,3个基因中A+T含量相近且明显高于C+G的含量;COⅠ和Cyt b基因的单倍型数量明显多于16S rRNA基因;COⅠ和Cyt b基因的遗传多样性比16S rRNA基因高;系统进化树显示,3个基因片段的进化速度:COⅠ>Cyt b>16S rRNA;中性检验和岐点分布图结果表明,闽江河蚬群体很稳定,均未发生过大规模的种群扩张等历史事件。综上所述,闽江6个河段河蚬在形态上没有存在显著的差异,河蚬的COⅠ、Cyt b比16S rRNA基因遗传多样性更高、进化速度更快,即使分化出独立的遗传群体,也未发生过大规模的种群扩张等历史事件,可作为一个整体进行保护和开发应用。